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Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  26 lines
  1. ****************************************
  2. * Yeast PIR proteins repeats signature *
  3. ****************************************
  4.  
  5. Three yeast extracellular glycoproteins that are characterized by the presence
  6. of 8 to 11 tandem  repeats of a region of 18 to 19 residues have been recently
  7. isolated [1].  These  proteins are  known as PIR1, PIR2 (also known as HSP150)
  8. and PIR3. The exact function of the PIR proteins is not yet known.
  9.  
  10. The core  region  of  the  repeat  is  highly  conserved and is used here as a
  11. signature pattern.
  12.  
  13. One occurrence of the core region is also present  in  the  yeast  serine-rich
  14. proteins  SRP1 and TIR2 [2].  The  PIR  proteins  as well as SRP1 and TIR2 are
  15. induced upon stress conditions.
  16.  
  17. -Consensus pattern: S-Q-[IV]-[STG]-D-G-Q-[IV]-Q-A-[STA]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: June 1994 / Text revised.
  21.  
  22. [ 1] Toh-E A., Yasunaga S., Nisogi H., Tanaka K., Oguchi T., Matsui Y.
  23.      Yeast 9:481-494(1993).
  24. [ 2] Bairoch A.
  25.      Unpublished observations (1994).
  26.